Boadella d´Empordà es troba situat a uns 14 km. al NO de Figueres. Pertany a la província de Girona i a la comarca de l´Alt Empordà.

Per la carretera N-II i direcció a França es pot entrar en el poble de Pont de Molins i seguir la carretera comarcal que condueix a Les Escaules i després Boadella, a uns 3 km. També es pot agafar una carretera que condueix des de la N-II a Biure d´Empordà i seguidament a Boadella.

El terme municipal, d´una extensió de 10´73 km2, està format pels pobles de Boadella i Les Escaules. Boadella és el cap de terme, situat a la riba dreta del riu la Muga, i a 89 m. d´altitud. Les Escaules es troba a 3´3 km. Muga avall i també a la dreta d´aquest riu. El municipi ocupa una petita vall regada pel riu Muga en el seu curs mitjà, abans d´entrar en contacte amb la plana empordanesa.

Aquesta vall es troba envoltada per muntanyes i pujols que no superen els 300 m. d´alçada i que són els últims contraforts pirinencs que limiten la plana empordanesa. Al N es destaca la serra dels Tramonts i a migdia la dels Eixarts, les carenes de les quals formen la divisòria amb els termes veïns de Biure i Terrades; al SE limita amb el de Llers i Pont de Molins i al NW amb el de Darnius. Els cims més alts del terme són el Puig del Penjat ( 263 m.), Puig Cargol ( 260 m.), Puig Gros ( 191 m.) i Puig Molló.

El riu Muga travessa el terme municipal de NW a SE. Un altre curs fluvial de certa importància és el torrent de la Caula. Aquest torrent, a uns 500 m. a llevant del poble de les Escaules, forma un saltant d´aigua de 30 m. d´alçada. Hi ha altres torrents de curs irregular, com el córrec del Mas Serra, el del Noguer, dels Arbres i córrec Fondo.